Situats al nord de la Costa Brava, entre les poblacions de Castelló d’Empúries, Empuriabrava i Sant Pere Pescador, aquests aiguamolls antigament ocupaven gairebé tota la plana de la badia de Roses. L’extensa àrea de maresmes es va reduir a causa, sobretot, de l’expansió agrícola, amb arrossars, i la ramaderia, amb closes per a la pastura.
El Parc Natural dels Aiguamolls de l’Empordà és una zona de gran interès biològic, però també de gran valor paisatgístic, cultural i econòmic. Disposa de diversos serveis com el centre d’informació, el centre de documentació i un museu d’història natural dels aiguamolls. El territori es caracteritza principalment per la presència de materials al·luvials que es transformen en marins després de passar per una zona de transició. Es tracta d’una extensa àrea d’interessant fauna i flora, que atrau nombroses aus migratòries, sigui de pas o d’acollida, procedents del centre d’Europa i del continent africà a la recerca de millors condicions ambientals durant les èpoques d’escàs aliment i meteorologia rigorosa.